聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）的優勢

• 穩定的化學交聯凝膠
• 更大的分辨能力（尖銳頻段）
• 可以容納大量DNA，而不會顯著降低分辨率
• 從聚丙烯酰胺凝膠中回收的DNA非常純凈
• 聚丙烯酰胺凝膠的孔徑可以通過改變兩種單體的濃度以容易且可控的方式改變。
• 適合分離低分子量片段

聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）的缺點

• 通常比瓊脂糖凝膠更難以制備和處理，包括更長的制備時間。
• 有毒單體
• 凝膠準備工作繁瑣，而且經常泄漏
• 每個實驗需要新的凝膠穩定的化學交聯凝膠